MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 genome

Total Repeats: 5601

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021081	GGC	2	6	232492	232497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_021081	GCT	2	6	234371	234376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_021081	GCAA	2	8	234385	234392	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
504	NC_021081	GTC	2	6	234426	234431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_021081	GCG	2	6	234434	234439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_021081	TGC	3	9	234503	234511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_021081	TCA	2	6	234570	234575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_021081	GGTT	2	8	234626	234633	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
509	NC_021081	GGA	2	6	234666	234671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
510	NC_021081	AGCA	2	8	234696	234703	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
511	NC_021081	T	6	6	234737	234742	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_021081	TGG	2	6	234784	234789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
513	NC_021081	GT	3	6	234849	234854	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
514	NC_021081	GT	3	6	234900	234905	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
515	NC_021081	ACCG	2	8	235528	235535	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
516	NC_021081	AC	3	6	236779	236784	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
517	NC_021081	CGG	2	6	236790	236795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_021081	AGT	2	6	237071	237076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_021081	AGA	2	6	237081	237086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_021081	GGGGT	2	10	237129	237138	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
521	NC_021081	TTGG	2	8	237147	237154	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
522	NC_021081	GTT	2	6	237165	237170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_021081	CCA	2	6	239366	239371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
524	NC_021081	CGCC	2	8	240364	240371	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
525	NC_021081	TGC	2	6	240373	240378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_021081	AC	3	6	240430	240435	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
527	NC_021081	G	8	8	240479	240486	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
528	NC_021081	A	6	6	240516	240521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_021081	A	6	6	240605	240610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_021081	CAACA	2	10	241615	241624	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
531	NC_021081	GCT	2	6	241766	241771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_021081	GCA	2	6	241803	241808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_021081	GC	3	6	241814	241819	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
534	NC_021081	AC	3	6	241835	241840	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
535	NC_021081	CCG	2	6	242005	242010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
536	NC_021081	GCT	2	6	242126	242131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_021081	ATG	2	6	242149	242154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_021081	ATG	2	6	246291	246296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_021081	GCA	2	6	246434	246439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_021081	GAC	2	6	246528	246533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_021081	CCG	2	6	246559	246564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
542	NC_021081	TGG	2	6	246576	246581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
543	NC_021081	G	6	6	246605	246610	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
544	NC_021081	AGTT	2	8	246632	246639	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
545	NC_021081	T	6	6	246638	246643	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_021081	AAT	2	6	246670	246675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_021081	CTATAG	2	12	246762	246773	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
548	NC_021081	CTA	2	6	246802	246807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_021081	CCA	2	6	246893	246898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
550	NC_021081	T	8	8	246969	246976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_021081	GTT	2	6	246998	247003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_021081	T	7	7	247002	247008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_021081	ATG	2	6	247046	247051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_021081	TCA	2	6	247120	247125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_021081	GAA	2	6	247166	247171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_021081	AT	3	6	247308	247313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_021081	TG	3	6	247341	247346	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
558	NC_021081	TGT	2	6	247371	247376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_021081	ATG	2	6	247424	247429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_021081	ATT	2	6	247480	247485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_021081	GTG	2	6	247509	247514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
562	NC_021081	GCTA	2	8	247578	247585	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
563	NC_021081	CTCC	2	8	247612	247619	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
564	NC_021081	AG	3	6	247703	247708	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
565	NC_021081	CGG	2	6	247715	247720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_021081	CTG	2	6	247805	247810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_021081	G	6	6	247824	247829	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
568	NC_021081	GGTA	2	8	247895	247902	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
569	NC_021081	CCTT	2	8	247904	247911	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
570	NC_021081	TGG	2	6	247922	247927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
571	NC_021081	GCG	2	6	247982	247987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_021081	AGGG	2	8	248019	248026	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
573	NC_021081	GGT	2	6	248028	248033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
574	NC_021081	CGG	2	6	248039	248044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_021081	ATG	2	6	248186	248191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_021081	T	6	6	248201	248206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_021081	CAA	2	6	248207	248212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_021081	AAC	2	6	248291	248296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_021081	GAT	2	6	248314	248319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_021081	GGCT	2	8	248367	248374	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
581	NC_021081	TTG	2	6	248378	248383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_021081	AGA	2	6	248396	248401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_021081	TTTC	2	8	248420	248427	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
584	NC_021081	T	6	6	248447	248452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_021081	T	7	7	248468	248474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_021081	AT	3	6	248646	248651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_021081	TATT	2	8	248701	248708	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_021081	TGCTT	2	10	248730	248739	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
589	NC_021081	TAG	2	6	248803	248808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_021081	TGC	2	6	248891	248896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_021081	AGG	2	6	248979	248984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
592	NC_021081	TAC	2	6	249021	249026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_021081	T	6	6	249027	249032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_021081	GT	3	6	249035	249040	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
595	NC_021081	GCTA	2	8	249046	249053	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
596	NC_021081	T	7	7	249213	249219	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_021081	CGG	2	6	249243	249248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_021081	GCTA	2	8	249282	249289	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
599	NC_021081	ACA	2	6	249290	249295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_021081	TGT	2	6	251926	251931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_021081	TGC	2	6	253771	253776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_021081	CAG	2	6	254502	254507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_021081	CCT	2	6	255792	255797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
604	NC_021081	CT	3	6	260341	260346	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
605	NC_021081	GCTG	2	8	262172	262179	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
606	NC_021081	TCC	2	6	265290	265295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
607	NC_021081	TCC	2	6	267941	267946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
608	NC_021081	AGG	2	6	270524	270529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
609	NC_021081	CTGG	2	8	270566	270573	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
610	NC_021081	TGG	2	6	270577	270582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
611	NC_021081	TG	3	6	270587	270592	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
612	NC_021081	GC	3	6	270596	270601	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
613	NC_021081	AT	3	6	270629	270634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_021081	GTAGT	2	10	270652	270661	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
615	NC_021081	T	6	6	270684	270689	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_021081	TCTGG	2	10	271805	271814	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
617	NC_021081	GCAA	2	8	271853	271860	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
618	NC_021081	AAC	2	6	271861	271866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_021081	GGT	2	6	271907	271912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
620	NC_021081	CAC	2	6	271948	271953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
621	NC_021081	ATT	2	6	271958	271963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_021081	GAGT	2	8	271964	271971	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
623	NC_021081	TGG	2	6	272033	272038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
624	NC_021081	GCGGCT	2	12	272646	272657	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_021081	GC	3	6	272674	272679	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
626	NC_021081	TAG	2	6	272683	272688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_021081	GGCTG	2	10	272703	272712	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
628	NC_021081	ACC	2	6	272772	272777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
629	NC_021081	CGG	2	6	274569	274574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_021081	CTG	2	6	274577	274582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_021081	AAG	2	6	277932	277937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
632	NC_021081	TAC	2	6	277981	277986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_021081	TAAA	2	8	278020	278027	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_021081	ACC	2	6	278050	278055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
635	NC_021081	TTGC	2	8	278093	278100	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
636	NC_021081	GCG	2	6	278159	278164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_021081	TTC	2	6	278188	278193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_021081	T	6	6	278220	278225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_021081	AGG	2	6	278270	278275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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761	NC_021081	CGG	2	6	339367	339372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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